爱华网民营科技园区运行机制是指技术、人才、资金、政策、设备、市场、信息和管理等要素组成的运动系统在实现其系统整体功能和目标过程中的规范和程序。它主要包括动力机制、激励机制、经营管理机制和支撑环境保障机制。这些机制之间既相互区别又相互联系，它们共同作用于系统中的各要素，使系统有序、稳定运转，最终实现科技产业化的系统目标。
1．动力机制
民营科技园区系统运行的动力是技术创新、市场需求和社会支撑力等多种动力共同作用的结果。首先，作为一个以技术创新为方向，以发展民族科技产业为目标的特殊区域，技术创新是民营科技园区生存和发展的根本所在。因此，对科技进步的需求是园区系统运行的内在动力，也是带动其它动力的原动力。其次，市场需求是技术创新之母，它是吸引企业进行技术创新的拉力，市场需求目的性越具体，技术创新的市场拉力越大，企业进行技术创新的动力也越大。对于民营科技园区而言，民营科技企业是其主体。民营科技企业具有市场性、知识性和创新性的特征，实行一种以市场为导向、以技术创新为方向、按照市场机制运行的发展模式，这决定了市场需求拉力是民营科技园区系统运行的重要动力之一。再次，技术创新过程涉及各种资源和生产要素的重组问题。在我国市场经济体制尚不完善、民营科技企业总体实力还较弱的情况下，仅靠企业自身的力量往往难以解决技术创新所需要的资源和生产要素。此时，社会支撑力就成为企业技术创新的“瓶颈”。社会支撑力主要是政府以法律、法规、政策等方式为企业技术创新提供支持；另外，还要求其它社会组织在技术服务、成果信息、风险投资、文化氛围创造等方面为企业技术创新提供支撑。因此社会支撑力是民营科技园区系统运行的又一重要动力。
2．激励机制
民营科技园区的激励机制是利用物质和精神等手段，去激发和增强园区系统的活力和动力，它的完善程度对动力机制正常运行有较大影响。
民营科技园区系统中的各组织系统，既受其他组织激励力的影响，又受其组织的行为而影响和激励其他组织。如政府推动系统通过其系统行为（如政策、法律、织织管理等），激励科技成果供给系统、产业化主体系统和社会化保障系统；这些系统的行为又激励着政府推动系统，使其产生进一步推动技术创新的激励力。在整个园区系统中政府推动系统的激励力对其他各系统的激励作用较大，通常政府的激励是通过一系列鼓励支持政策来实施的，既有物质方面的激励又有精神方面的激励。而科技成果供给系统及产业化主体系统对预期经济利益目标的追求，是激励其进行技术创新的基础；同时各种激励措施的建立与完善，激励系统内组织成员的技术创新愿望，有利于创造一个良好的技术创新环境。
由此可见，激励机制的建立需要在三个不同层次上实施，一是整个系统的激励，发挥主导作用的是政府的激励；二是以预期经济利益为激励驱动力的组织系统间的激励；三是组织系统内的激励，促使组织内部成员对技术创新产生强烈的愿望和行为。建立有效的激励机制的关键在于：明确被激励的对象和范围，综合运用物质和精神激励手段，实现各层次的有效激励。
3．经营管理机制
民营科技园区的经营管理机制包括微观与宏观两个方面，进一步从微观与宏观上建立和完善园区的经营管理机制对民营科技园区的有序、稳定运行至关重要。
（1）微观经营管理机制。这是指民营科技园区系统内部的经营管理机制。其核心是企业新的经营机制——民营机制，即独立自主的决策机制、面向市场的经营机制、优胜劣汰的用人机制、收入与资本收入、劳动贡献、企业效益挂钩的分配机制，风险职责与自我激励、自我约束相结合的行为调整机制，以及技术创新与科学管理相结合的增长机制等六个方面。当前，应进一步落实民营科技企业的自主权，充分尊重民营科技企业的市场主体地位和法人财产权，保持企业经营班子和研究开发队伍稳定，赋予企业经营者对经营决策的自主权、对企业财产的调配权、对企业用人的选择权和对企业内部分配的调控权。同时要推动民营科技企业进行产权界定，以此推动大中型民营科技企业实行公司制改造，建立规范化的股权结构、法人治理结构和内部管理制度，鼓励中小型民营科技企业积极探索新的企业组织形式，逐步向现代企业制度过渡。
（2）宏观调控。这是指国家机关利用管理和法律手段对民营科技园区系统运行进行必要的宏观调控。园区系统的微观运行机制，必须在国家的宏观调控下才能更好地发挥作用。国家通过制定发展战略、规划和计划，作为宏观调控的主要行为准则；依靠不同层次的行政管理机构，对法规、政策、制度、税收、贷款、基金、信息、人才培养等方面进行宏观管理。政府部门的宏观调控通过引导、协调、服务、监督和控制，规范民营科技园区的组织和行为，为民营科技企业的发展创造一个良好的局部环境，加速科技成果的转化和高新技术产业化。
4．支撑环境保障机制
支撑环境保障机制是指支撑民营科技园区运行的外部社会环境所应具有的保障机能。它主要包括以下内容：
（1）社会服务体系的优化。健全、完善的社会服务体系是民营科技园区建设和发展的必要条件，是联结产、学、研的重要纽带。民营科技园区的服务机构包括创业中心、风险投资、要素市场、信息网络、知识产权服务机构、上市推介服务机构、生产力促进中心、各类科技中介服务机构等。要通过不断优化社会服务体系，为民营科技企业在融资、人才引进、技术开发、培训和企业战略等方面提供咨询和创业服务，不断提高服务水平和质量，全力支持他们创办科技企业，发展民族科技产业。
（2）物流的优化。这是指对支撑民营科技园区系统运行的外部硬环境保障因素的优化。这类支撑系统运行的硬环境保障因素是多种多样的，如地理环境、交通设施、通讯网络、金融机构、要素市场等。对这类支撑环境因素的优化，是促进园区系统内部与外部、输入与输出之间的物流畅通，并实行良性循环发展的重要保障。进一步优化和完善物流机制的内容和结构，将使园区系统向有序化、高级化的方向运行。
（3）信息流的优化。民营科技园区系统是一个开放系统，它与周围环境之间的交互作用，既受物流又受信息流的支配和影响。信息流的优化，主要是对支撑系统运行的外部软环境保障因素的优化。这类软环境保障因素有政治、法规、政策、制度、体制、竞争、咨询服务和信息服务等。对这类支撑环境因素的优化，是促进园区系统内部与外部、输入与输出之间的信息流沟通，并使系统处于稳定发展状态的重要保障。进一步优化和完善软支撑环境，充分有效地利用外部的信息资源，以最大限度地加快我国科技成果商品化、产业化和国际化进程，这是优化信息流的本质要求。
