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战略性预算反映的不是在现有运营基础上的改进，而是为了填补现有绩效和期望达成的突破性绩效之间的差距，而采取的战略性行动产生的预算。战略性预算能找出哪些新的运作需要改进，哪些能力需要提高，哪些产品和服务需要发布，哪些新的服务必须到位，哪些新的市场、新的区域必须攻占，哪些新的联盟必须建立。
尽管战略性预算可能只占企业组织全部预算开支的10%，但它对实施企业组织新的战略并取得未来成功意义重大。对于大多数企业来说，区别战略性预算和经营性预算是件新鲜事，但是基于平衡计分卡为基础的战略实施管理系统，则是清楚的，因为战略性预算包含在组织的主要战略性行动当中。
每一个经营单位都应当找出关键的战略行动，以图实现企业的长期目标。这些战略行动包括：新产品的开发、现有生产能力的提升、客户群体的拓展等。战略行动计划一旦被批准，就会得到高层领导的支持，形成项目小组，并获得预算，这就是战略配称。许多公司战略执行失败就是因为所需要的人员、资金和财务资源没有在预算中得到支持和保障，战略目标和战略期望是好的，具体预算克扣紧缩，导致无法开展工作，项目夭折，这是大部分企业常犯的错误。特别提醒的是，在战略预算中，其预算管理指导思想是预算的配置作用大于控制成本作用。
战略预算的流程是战略→目标→衡量指标→挑战性目标值→行动计划，而不是战略→行动计划→衡量指标。战略规划流程应该用行动计划来帮助企业组织实现目标，而不是以行动计划本身作为结果，我们在实际工作中，常常把行动计划是否完成当作目标。
