爱华网缺乏统一的HIS建设规范和技术标准
各类信息系统建设的规范和标准的缺乏，是制约卫生信息化推广应用的“瓶颈”。虽然国家有关部门和卫生部门出台了一系列规范和标准，但仍然满足不了信息化建设的需要。由于缺乏统一的规划和统一的标准，各个医疗单位很多信息资源无法共享，有的甚至在医院自己内部都无法共享，造成了极大的资源浪费和重复劳动。现在，不少医院虽然也搞了看病刷卡的就诊方式，方便了病人，但由于没有标准，每个医院都有自己的卡，病人到不同的医院都得重新买卡，使本来简单的问题又复杂化了。
医院信息人才奇缺
一位专家说，我们并不缺乏卫生专业人才，缺的是计算机方面的专业技术人才，更为缺乏的是既有医学基础知识和卫生管理理论，又有良好的计算机专业理论和实践知识的复合型人才。关键的问题还在于技术人员不了解医院。从当初的单机，到局域网，再到广域网，对操作人员的素质提出了更高要求，人才的匮乏、现有人员业务素质的提高显得十分迫切。
缺乏以病人为中心的服务理念
现在，不少医院虽然也搞了看病刷卡的就诊方式，方便了病人，但由于没有标准，每个医院都有自己的卡，病人到不同的医院都得重新买卡，使本来简单的问题又复杂化了。因为即使有的医院考虑到了患者的需求，但医院与医院之间没有信息共享，从而导致患者身上积累了很多就诊卡，以致于都忘记是哪家医院的。
政策法规限制
卫生信息化的应用和发展离不开国家法律、法规、政策体系的支持，虽然国家颁布了一系列如《卫生信息化功能规范》等文件，但却没有做到实处，导致下面的医院仍然存在一些问题，如医院信息化资金发展不足、医院领导重视不够等，因此要逐步研究和完善发展相关法规和政策，如信息技术人才政策、信息设备采购政策、行业信息应用软件开发和技术服务等方面的政策。卫生信息化建设具有公共产品的特征，需要得到政府财政的支持。
