由于芍药花型富有变化，从而使分类方法也有多种，目前多采用北京林业大学园林系的花型分类法。
芍药根据颜色可分为白、黄、绿、粉、粉蓝、红、紫红、紫、黑、复等多个品种。根据花型可分为蔷薇型、皇冠型、千层台阁型、托桂型、金环型、菊花型、绣球型、楼子台阁型、单瓣型等。
中国产的芍药组植物有八种和六个变种，其中通常直称为芍药的，是近代芍药品种群的主要原种。八种芍药分别是：草芍药、美丽芍药、芍药、多花芍药、白花芍药、川赤芍、新疆芍药和窄叶芍药。
草芍药别名山芍药、野芍药，花白色、红色、紫红色。其变种有毛叶草芍药。
美丽芍药花红色。
芍药花白色，有时基部具深紫色斑块。其变种有毛果芍药。
多花芍药花白色。
川赤芍的花多为紫红色或粉红色。其变种有毛赤芍、光果赤芍、单花赤芍。
新疆芍药的花红色。
窄叶芍药花紫红。有变种块根芍药。
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