人类虹膜的基色只有三种:褐色、蓝色和绿色。其他颜色的虹膜则是这三种颜色的变体。
褐色是最常见的人类虹膜颜色。褐色虹膜含有大量黑色素,深褐色虹膜看起来像黑色。褐色虹膜被认为是人类虹膜的显性基因,但最近的研究认为这不一定正确。
蓝色虹膜在欧洲比较常见,全世界约8%的人口有蓝色虹膜,北欧人如冰岛人、芬兰人和拉脱维亚人约80%以上为蓝色眼睛。
绿色虹膜是最罕见的颜色。在欧洲的凯尔特人、日耳曼人和斯拉夫人中比例较高;欧洲以外,一些普什图人、土耳其人也有绿色虹膜。古代吉尔吉斯人也是。
淡褐色的眼睛是瑞利散射和中等程度的黑色素在虹膜前方膜层的组合所造成。淡褐色很难界定。它们被描述成浅褐色或黄褐色。有人认为淡褐色是褐色和蓝色虹膜的中间色。
灰色被认为是蓝色虹膜的变种。
琥珀色在其他动物上较为常见,它比棕色更浅,很少在人类出现,又被称为猫眼色。琥珀色在欧洲比例多,或多是混血儿。
虹膜异色症是一种身体异常状况,指两眼的虹膜呈现不同颜色的性状。眼睛的颜色,特别是虹膜的颜色是由虹膜组织的色素沉淀及分布决定的。因此在形成过程中任何因素影响以上的色素分布就会造成眼睛颜色的不同。对于两只眼有不同颜色虹膜的人或动物,我们亦会称他/它拥有“双色瞳”或“金银妖瞳”。例如:可能一边眼是蓝色,但另一边却是灰色的。可能是因为患上HornerSyndrome或虹膜毛样体炎,使虹膜造成损伤而萎缩。