发布时间：2022年04月15日 05:36:33分享人:暗香疏影来源:互联网20
1. 在使用RCSBPDB搜索时，会遇到无此蛋白情况~其————情况可能是此蛋白有别的名称，如Amiloride-sensitive sodium channelα-subunit，在PDB中就无法搜到相应数据，此时可以利用Drugbank,BindingDatebase,Google,EMBL,Uniport,ZINC等数据库或搜索引擎进行检索。
1.1 以此蛋白(Amiloride-sensitive sodium channelα-subunit)为例，在google和Uniport上能检索到相关信息，Uniport显示此蛋白的名称有Recommendedname:
Amiloride-sensitive sodium channel subunitalpha
Alternativename(s):
Alpha-NaCH
Epithelial Na(+) channel subunit alpha
Shortname=Alpha-ENaC
Nonvoltage-gated sodium channel 1 subunit alpha
SCNEA而通过google搜索到的信息更多了，通过谷歌检索到Drugbank数据库，而Drugbank显示此蛋白的Synonyms名称有：有了这些名字再在PDB中检索出来的几率就会大大增加。 1.2此外Wikipedia是一个很强大的工具，可直接对蛋白质名称进行检索，如果有此蛋白数据的话在页面的左方就会显示出此蛋白在各种数据库中的链接，其中就可能包括指向PDB数据库的。 1.3通过Ligand的进行逆向检索也不失为一种方法。2. 若要进行模拟或进行CADD，则resolution最好低于2.00Å；最好是Co结构，即complex
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