R语言tar.gz后缀window环境安装攻略 tar 指定后缀



R语言使用时,我们经常会碰到下载一个cran上没有的包,命名规则为name.tar.gz这样的包我们如何安装使用呢。
例如,我们在下面的网站
http://linchen.fhcrc.org/grass.html
发现一个包,点source下载后为SNPath.tar.gz
下面我们以这个包为例详细讲述安装操作过程:
(1)Rtools安装
R包windows下可以本地安装的包是已经编译好的二进制文件。
而我们常常下载的name.tar.gz,这个是R语言写的源代码。
所以要把这个转化成二进制文件后才能装上。
我们借助Rtools工具完成。
我们可以用Rtools自带的INSTALL命令来完成。
Rtools下载地址:
http://mirror.fcaglp.unlp.edu.ar/CRAN/
选择合适的版本,我的R是3.1.0,我选择Rtools215.exe
执行安装。
(2)配置环境变量
装完Rtools215.exe以后,把rtools的bin目录和gcc-4.6.3对应的bin目录设置环境变量。gcc是c++的bin
右键-》我的电脑-》高级-》环境变量-》系统变量下面的Path双击-》在值的后面打个分号,后面追加,也就是Rtool的bin目录和gcc的bin目录即: C:Rtoolsbin;C:Rtoolsgcc-4.6.3bin
注意:上面是我的电脑的路径,我把Rtools装到c盘,如果你装到别处,你可以自行修改路径,别忘了先打分号“;”分隔一下,再加入目录。
(3)拷贝包到C:ProgramFilesRR-2.14.2bini386下,进入dos执行安装。
然后把包Path.tar.gz拷贝到C:ProgramFilesRR-3.1.0bini386
开始,寻找程序,键入cmd进入dos命令界面
cmd-》cd C:Program FilesRR-3.1.0bini386
回车
然后执行rcmd INSTALL SNPath.tar.gz
这个是利用C:ProgramFilesRR-3.1.0bini386下的INSTALL命令安装包,注意大写
如果安装不成功,看提示内容,是缺少了一些必备的R包,这可以在R的主界面上进行安装。
SNPath.tar.gz这提示的错误是
R语言tar.gz后缀window环境安装攻略 tar 指定后缀
corpcor
snow
Zelig
survey
这四个包没装,用R的界面 程序包-》装程序包-》找到包装上就行。
装完补充的包后
再重新执行一下rcmd INSTALL SNPath.tar.gz
这样就ok了。
(4)查看是否安装成功。
打开R的界面,写入下面脚本,运行
library(corpcor);
library(snow);
library(Zelig);
library(MASS);
library(boot);
library(survey);
library(SNPath);

如果查看SNPath里面有什么函数可以用
ls('package:SNPath')

  

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