R语言使用时,我们经常会碰到下载一个cran上没有的包,命名规则为name.tar.gz这样的包我们如何安装使用呢。 例如,我们在下面的网站 http://linchen.fhcrc.org/grass.html 发现一个包,点source下载后为SNPath.tar.gz 下面我们以这个包为例详细讲述安装操作过程: (1)Rtools安装 R包windows下可以本地安装的包是已经编译好的二进制文件。 而我们常常下载的name.tar.gz,这个是R语言写的源代码。 所以要把这个转化成二进制文件后才能装上。 我们借助Rtools工具完成。 我们可以用Rtools自带的INSTALL命令来完成。 Rtools下载地址: http://mirror.fcaglp.unlp.edu.ar/CRAN/ 选择合适的版本,我的R是3.1.0,我选择Rtools215.exe 执行安装。 (2)配置环境变量 装完Rtools215.exe以后,把rtools的bin目录和gcc-4.6.3对应的bin目录设置环境变量。gcc是c++的bin 右键-》我的电脑-》高级-》环境变量-》系统变量下面的Path双击-》在值的后面打个分号,后面追加,也就是Rtool的bin目录和gcc的bin目录即: C:Rtoolsbin;C:Rtoolsgcc-4.6.3bin 注意:上面是我的电脑的路径,我把Rtools装到c盘,如果你装到别处,你可以自行修改路径,别忘了先打分号“;”分隔一下,再加入目录。 (3)拷贝包到C:ProgramFilesRR-2.14.2bini386下,进入dos执行安装。 然后把包Path.tar.gz拷贝到C:ProgramFilesRR-3.1.0bini386 开始,寻找程序,键入cmd进入dos命令界面 cmd-》cd C:Program FilesRR-3.1.0bini386 回车 然后执行rcmd INSTALL SNPath.tar.gz 这个是利用C:ProgramFilesRR-3.1.0bini386下的INSTALL命令安装包,注意大写 如果安装不成功,看提示内容,是缺少了一些必备的R包,这可以在R的主界面上进行安装。 SNPath.tar.gz这提示的错误是 corpcor snow Zelig survey 这四个包没装,用R的界面 程序包-》装程序包-》找到包装上就行。 装完补充的包后 再重新执行一下rcmd INSTALL SNPath.tar.gz 这样就ok了。 (4)查看是否安装成功。 打开R的界面,写入下面脚本,运行 library(corpcor); library(snow); library(Zelig); library(MASS); library(boot); library(survey); library(SNPath); 如果查看SNPath里面有什么函数可以用 ls('package:SNPath') |
R语言tar.gz后缀window环境安装攻略 tar 指定后缀
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