蛋白PDB文件格式 蛋白质数据库pdb

数据类型

字段名称

定义描述

1 - 6

Record name

"DBREF "

8 - 11

IDcode

idCode

记录的ID号

13

Character

chainID

链的标识符

15 - 18

Integer

seqBegin

PDB序列片段的起始序列号

19

AChar

insertBegin

PDB序列片段的起始插入代码

21 - 24

Integer

seqEnd

PDB序列片段的终止序列号

25

AChar

insertEnd

PDB序列片段的终止插入代码

27 - 32

LString

database

序列数据库名称如PDB,SWS,当一个相应的序列数据库记录还未识别时即存放PDB

34 - 41

LString

dbAccession

序列数据库的访问号码,如对于GenBank来说即是NCBIgi

43 - 54

LString

dbIdCode

序列数据库的识别密码,对GB来说即是访问号码

56 - 60

Integer

dbseqBegin

数据库片段的起始序列号

61

AChar

idbnsBeg

涉及到PDB的话,存放片段起始残基的插入代码

63 - 67

Integer

dbseqEnd

数据库片段的终止序列号

68

AChar

dbinsEnd

涉及到PDB的话,存放片段终止残基的插入代码。


原文出自:蛋白质PDB文件说明.doc

英文版:PDB Primary Structure Section
蛋白PDB文件格式 蛋白质数据库pdb



from:Valeri Barsegov Molecular Dynamics Simulations:Lecture 16 & 17

  

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