爱华网有的药材用它的突出点命名，有药材因为具有特效而流传成故事，因此也用来命名。有的药材是该地道产质量量最好，以产地冠以命名。更有的是某些药材有生长特性、药用部分；从国外进口、名称译音等，都以此作为药材命名的依据，现将它们的命名分述如下：
1、因功用而命名
某些药物根据其功用的特点而命名：如防风能防治外感风邪，益母草可治妇产科病，大风子治疗大麻风，淫羊藿可治阳萎，石决明、决明子能明目，续断能续筋接骨等。
2、因气味而命名
某些药物有特殊的气味，则按气味特点命名，具有芒香气味者如沉香、麝香、苏合香、安息香、丁香、茴香、乳香、藿香、木香、香薷等。臭气难闻的有臭梧桐、臭牡丹、臭阿魏、鸡屎藤等。有甜味的如甘草、甘松；苦味的如苦参、苦楝子；辣味者细辛、辣椒；酸味者酸枣仁；咸味者咸秋石、咸翻新石；淡味者淡竹叶；五味俱备者如五味子。
3、以药材的形态而得名者
很多中药具有各种天然颜色，故其颜色亦可作命名之源，如红色者有红花、赤芍、丹参、朱砂、赫石（猪肝色）；白色的有白芨、白芷、白术、白薇、白前、白花蛇舌草等；黑色的玄参、乌梅；黄色的有黄连、黄芩、黄柏、橙皮（橙黄色）；青色的有青黛、青蒿、大青叶、玄参（断面黑色）；青黛（表蓝色），紫草（内外皆紫色），紫色地丁（其花色紫）等。
还有其形状亦可作命名之源，如马鞭草、鸡爪黄连、半边莲、乌头、皂角刺、人参、牛膝、木蝴蝶、凤尾草、头顶一枝香，罂粟壳和金樱子都有一个“罂”字，即大腹小口之瓶。
4、因生长特性而命名
夏枯草夏至后花叶枯萎，半夏成熟于仲夏，夏天无入夏后枯萎；忍冬之叶凌冬不凋；冬青之叶严寒尤青等都是以其生长特性作为命名之依据。
5、以药材采收季节命名
例如，冬桑叶，夏枯草，半夏，冬虫夏草（夏季采收），冬花（茎叶经冬不凋、花冬季盛开）。
6、因入药部分而命名（药材命名中最广者）
植物药有根茎叶花果实种子之别，动物也有皮肉骨内脏之异，故其入药部分可作命名之依据，如麻黄根、葛根药用其根，苏叶、桑叶、荷叶、侧柏叶均用其叶，苏梗、荷梗、藿梗均用其茎梗，莱菔子、白芥子、牛蒡子用子而名，金银花、旋夏花、菊花、玫瑰花用其花而名之，枳实、芡实均用其果实；动物药中有刺猬皮、虎骨、熊胆、獭肝、犀角、羚羊角等名称，均以其入药部分而命名之。
7、因秉性而命名
按药物原有的性质来命名，如急性子，其性急猛异常；苁蓉补而不峻，有从容和缓之性；王不留行，走而不守；沉香性沉重，小麦性轻浮者称浮小麦等。
8、因产地而命名
如蜀椒、巴豆、川芎、川贝、川楝子、川连、川牛膝、川贝母、川白芷、川木通、川芎产四川，川贝母以四川松潘者为胜等；广防己、广霍香、广豆根则产于两广地区；浙江产而于杭州集散者有杭白芷、杭菊花、杭麦冬；阿胶为山东东阿县阿井之水熬驴皮而制成；河南省焦作温县古称为怀庆府，所产“山药”为怀山药，当地人又称为“怀参”，怀牛膝也以河南怀庆产者佳，怀庆府以“怀山药、怀菊花，怀地黄、怀牛膝”为世人称著；还有银柴胡（银川），多伦赤芍（内蒙古），藏红花，广木香。
9、人名命名
以人名命名大多带有传奇色彩；如使君子的命名，相传潘州郭使君疗小儿疳虫，常投此药获效；何首乌相传何姓老人常采食此药，年至130岁发犹乌黑，故名之；刘寄奴，此药为甯高祖刘裕所发明，以他乳名寄奴命名；其他尚有牵牛子（花）、预知子、徐长卿、蒲公英、白头翁、雷公草、昙花（韦驮花）、杜仲、（安）石榴、虞美人、二乔玉兰、湘妃竹、洛神花、刘寄奴、霸王花、帝女花、杜鹃花、水仙花、茉莉、牡丹、海棠、紫荆花、薰衣草等。
10、外来药物及译音命名
国外或少数民族地区输入之药材，常加“番”、“胡”，如番泻叶、胡黄连、胡椒；更有译名如（诃子）诃黎勒、曼陀罗、阿芙蓉等。西红花，西洋参，东洋参，高丽参（朝鲜参）。
11、以加工的药材改变原有的性状而形成特有的体质命名
例如，炙甘草，炮姜，焦白术，熟大黄，建曲，六神丸，阿胶，黄明胶，鹿角胶等。
12、以数码命名
一点红，一支黄花，一支蒿，二月律，三七，三棱，四季青，四块瓦，五味子，五谷虫，五倍子，六月雪，七叶一枝花，八月紮，八角茴香，九节菖蒲，九香虫，十大功劳，百草霜，千金子，万年青，七厘麻，七叶莲。
13、以十二生肖命名
龙胆草，蛇床子，牛蒡子，马兜铃，羊蹄，猪苓，狗脊，猴枣，菟丝子（兔耳风），鸡内金（鸡冠花，鸡血藤），鼠粘子（鼠妇虫），虎杖，虎耳草。
14以药材生长方位命名
例如，东防风，东贝母，西大黄，西河柳，南沙参，南梗桔，北五味，北细辛，北沙参，北豆根，中麻黄。
此外，尚有以大；小命名，如大枣、大蓟、大戟、大茴香、小茴香、小蓟；因贮久而命名如陈皮、陈仓米；药材珍贵难得或高效者，其命名常加宝，如马宝、狗宝；高效者如千年健、威灵仙等。以药材物理性质命名，例如，磁石。
