该师地处塔克拉玛干大沙漠西缘的叶尔羌河和喀什噶尔河流域,占地面积8043平方公里。下辖62个企事业单位,其中农牧团场18个,总人口16.9万人。地处叶尔芜河和喀什噶尔河流域,有"冰山之父"美誉的慕士塔格峰融化的雪水汇集到叶尔芜河,孕育着农三师万顷绿洲。现辖18个农牧团场和l5个独立核算工交建商企业,耕地面积l 103万亩,总人口l83万人,职工总数3.6万人。师部所在地为喀什市。农三师图木舒克市是兵团新兴城市。由于日照时间长、积温高,该师具有生产棉花、水果、小麦、水稻的优势,尤其是棉花产量和品质较高,曾在1990年21亩陆地棉皮棉单产达198.2公斤,创全国棉花单产最高纪录。
小海子水库管理处 农三师小海子水库管理处位于巴楚县境内,是一个以水利工程管理为主工、建、农、牧、渔多种经营的水利事业单位,团部设在固定职工500余人。库区有20余万亩养殖水面,耕地面积2000余亩,果园150亩,年产成鱼300余吨,库区半山环绕、环境优美、交通方便。该处管理着三座大型平原水库,总蓄水能力7亿立方米年,年平均引水10亿立方米,每年7-9月份昆仑山溶雪进行一次性蓄水,水质纯净,永安坝南北水库水草丰富,有10万多养殖面积。并有300千瓦小水电站一座可长年供电,又有西图线外供电源,为工农业生产和发展提供了稳定的能源保障。
前进水库管理处 农三师前进水库管理处位于塔克拉玛干沙漠西缘的麦盖提县东北部地区,团部设在距麦盖提县城20公里。全处共有人口700余人,职工人数223人。以水利管理业为主,进行水利施工和水产养殖。前进水库维吾尔地名又称哈拉玛水库,所辖灌区为四十三团、四十五、四十八团。最大设计库存为9500万立方米;最大淹没面积38万平方公里;正常年份蓄水6000万立方米;周转库容5000万立方米。有工程队和渔场两个下属单位,年产鲜鱼50-70吨,并种植水稻400余亩,年产大米近200吨。
农三师其克里克农场位于新疆喀什地区麦盖提县东南16.5公里处,团部设在其地貌属冲击平原,日照充足年均2806小时,降水量稀少,无霜期长。该场有耕地23000余亩,现有人口2492人,职工总数1082人,有13个建制单位.主要作物有:棉花、小麦,果品及少量的瓜菜。畜牧产品以闻名中外的刀郎羊为主。该场有大中型拖拉机20台;挖掘机2台;大型农机具50架件可以满足全部机械化作业,农场自修公路与麦泽公路相接,年货物运量1.2万吨。

伽师总场 农三师伽师总场,位于塔克拉玛干沙漠北缘,与314国道接壤。团部设在喀什地区伽师县阿克乔镇。土地面积6.013万公顷,现有人口1万人,职工2593人,少数民族占92%。总场面积60万亩,规划可开垦面积13万亩,现有耕地6万亩。近几年以每年收复改造5000亩弃耕地的速度,扩大生产规模。主要作物:棉花、小麦、水稻、瓜果等,棉花已突破亩产皮棉105公斤。主要特产伽师瓜闻名全国,畅销内地。
农三师莎车农场场部驻乌夏巴什镇,临近新藏公路。土地面积6.32万公顷,团场人口中少数民族人口占66.35%。
农三师东风农场阿图什市的欧吐拉巴羌镇。土地面积1.015万公顷,该团以小麦、玉米、棉花等为主要农作物,其中棉花是大宗产品,产量高。
农三师叶城牧场 位于喀什崎岖莎车县境内。农业生产有小麦、玉米、棉花、林果等,播种面积基本均衡,畜牧业有所发展,以养羊为主,存栏量有所提高。
农三师托云牧场位于克孜勒苏柯尔克孜自治州乌恰县境内。土地面积5.22万公顷,该团以畜牧业为主要产业,其中少数民族人口占95.59%。
农三师红旗农场位于喀什地区英吉沙县。土地面积0.763万公顷,农业生产主要有小麦、玉米、棉花、林果等,其中棉花是主要经济作物。