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1·若购买的是整棵水草，则要选择枝干结实，叶子茂盛，新叶正发而根深茂密的健康水草。
2·若为有茎水草，其茎叶呈笔直成长，其根需长在茎底部的节眼，以新芽明显且可辨认者为佳。
3·若为球茎水草，则必须重而有份量，新芽茂密结实地张开于球茎之外。
凡能符合上述三条件者，才能称为合格的水草。反之，若是整棵水草无根，或根已腐根，新芽成长状况不佳或生长停止；有茎水草其茎部以下开始腐烂且无根，叶子稀疏而只剩若干，且顶端无法辨识出新芽；球茎水草，不见其新芽生长，或不够重，茎叶无法伸展，且长有其它物质甚至发出恶臭者，都应避免购买，以免破坏整个水族生态环境。
水草买回后，用温度适合的自来水冲洗，并将其浸泡于10ppm的硫酸铜水溶液数分钟至10分钟。然后取出再以清水冲洗一次后，便可植入水族箱中。种植水草前，应先剪去旧叶或受损的根叶，以不伤到根部为原则，轻轻地将水草种入底砂，种入的位置应事先规划好，或可预先画好设计图，依所规划的位置植入。
若是新设置的鱼缸，则不宜将全部的水草一起植入，应先种植比较健康的水草，等水质安定后，再将其余的水草种入。如能注意上述细节，再难种的水草也会变得很好种。当然水草缸的布局及构图相当重要，因为它可以搭配出鱼缸的整体美。如红叶与绿叶，明色与暗色，圆形叶与细长叶等，应该相互交错种植，而较高大的水草宜放置在较后的位置，较矮小的水草，则可种在前面。值得一提的是，并非一定要种植各式各样花花绿绿的水草才会漂亮，而应注重整体的协调及对称，才是理想的布局。
种植水草的最佳位置
在水族缸中种植水草，首先要将水族缸放置于视线及温度较易控制的场所，不要放在太阳光直接照射或太过于阴暗的地方。此外，若能接近电源插座则会更方便。
在决定好水族缸安置的位置后，将水族缸清洗干净，放置在预定的地方，将三分一至二分之一的砂石，与适量的红土及草泥丸充分混合后，铺于水族缸底层，然后把所剩的砂石铺于沙石之上。砂石的厚度依水草种类不同而略有厚薄之差，一般以6 ～10厘米厚度为佳。如果砂石铺得太薄，则水草安全性差，浮力大的水草就容易浮上水面；但若铺得太厚，则会造成底层不易对流循环较差，易引起底层水的腐败。为解决水流循环不佳的问题，可在水族缸底部加装底部加温线，由热传导促进缸底水温对流( 此法在海外甚为流行)。使用此法的优点是利用水族缸底的水温所造成的缓和对流，使底砂的养份能被水草充分吸收，且可防止水质腐败。
整个水草种植完成后，便可开始加水，为防止底砂在加水时的流失与破坏而引起水的混浊，可在砂石上放置盘子或塑料布，再将水缓缓注入缸中。加水至某个高度后，再将部分混浊水抽出，然后再继续加水。如此重复几次，可确保水族缸中的水的清净。
其他附加设备
为了使水始终维持清净，还必须安装过滤器。当过滤器安装完毕后，再加上自动温度调节器，将水温保持在22～28℃之间。因为水草种类繁多，其最适宜生长的水温也不尽相同，但一般而言，将水温设定于2 4～26℃之间，几乎可以适应于各类水草。大部分水草生长于弱酸性的软水至中度硬水范围内。对于较结实的水草，使用去除次氯酸的自来水即可以，但若自来水中的P H值或硬度过高时，就必须用离子交换树脂软水器及泥炭过滤器处理，才能使水质转为弱酸性及软水。
